- Penghargaan Atas Komitmen Mencapai Universal Health Coverage (UHC) Tahun 2023
- Penghargaan Kab/Kota Terbaik yang Terintegrasi SISDMK dengan DPMPTSP
- Penghargaan Atas Kinerja dan komitmennya dalam Percepatan dan Kualitas Penyelesaian Tindak Lanjut Rekomendasi Hasil Pemeriksaan Inspektorat Daerah Kota Pekalongan Kategori OPD
- Penghargaan Terbaik I Pengelola Profil Kesehatan Kab/Kota Terbaik Jawa tengah Tahun 2022
- Penghargaan Juara I Pemeringkatan Profil Kesehatan Tingkat Kab/Kota di Indonesia Tahun 2022
- Penghargaan Perangkat Daerah dengan Kategori "MEMUASKAN" dalam Pengawasan Kearsipan Internal Tahun 2022
- Penghargaan Kabupaten/Kota Bebas Frambusia
- Penghargaan Apresiasi atas Dukungan dan Kerjasama dalam Pelaksanaan "Program Vaksinasi OJK"
- Penghargaan sebagai Kabupaten/Kota yang Memiliki 100% Puskesmas Terakreditasi dari Kementerian Kesehatan RI.
- Penghargaan Public Service of the Year Jawa Tengah 2018 dari Markplus.Inc